Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lbx1P52955 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms