Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbP41155 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms