Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms