Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtprmP28828 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtprmP28828 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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