Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms