Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms