Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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