Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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