Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms