Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms