Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms