Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Med28Q920D3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms