Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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