Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp27Q8CEG8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp27Q8CEG8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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