Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms