Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atf3Q60765 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atf3Q60765 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atf3Q60765 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms