Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec24aQ3U2P1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms