Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd8Q09XV5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd8Q09XV5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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