Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms