Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms