Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtpreP49446 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtpreP49446 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PtpreP49446 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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