Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms