Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sp100O35892 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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