Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Opn1mwO35599 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms