Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms