Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms