Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan10Q8VCF5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan10Q8VCF5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms