Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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