Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnot2Q8C5L3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms