Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms