Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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