Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pnma8aQ80VM8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms