Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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