Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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