Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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