Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tuba4aP68368 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms