Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms