Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms