Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms