Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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