Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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