Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tnnt3Q9QZ47 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnt3Q9QZ47 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnt3Q9QZ47 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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