Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Swt1Q9DBQ9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Swt1Q9DBQ9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms