Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CYI0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CYI0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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