Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms