Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms