Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf4Q8VE97 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms