Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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