Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp27Q8CEG8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp27Q8CEG8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms