Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprdQ64487 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprdQ64487 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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